האגודה למען הכרה בארבעים הכפרים הערביים הבלתי מוכרים בישראל, הוקמה רשמית בשנת 1988 בכפר עין-חוד ע"י תושבים מהכפרים ומתנדבים ערבים ויהודים ברחבי הארץ. האגודה הינה ארגון לא ממשלתי, שפועל למען צדק חברתי במגזר הערבי בישראל, ולמען הכרה בכפרים הבלתי מוכרים במגזר זה.
המרכז הפמיניסטי הוותיק ביותר בישראל ואחד הקולות המובילים במאבק למען זכויות נשים בארץ.
ארגון מתנדבים בינלאומי, א-פוליטי ובלתי תלוי, הפועל למניעת כמה מן ההפרות החמורות ביותר של זכויות האדם, שמבצעות ממשלות וקבוצות אופוזיציה.הארגון הוא בלתי תלוי בממשלות, באידאולוגיות פוליטיות או דתיות או באינטרסים כלכליים.
ארגון בזכות, המרכז לזכויות אדם של אנשים עם מוגבלויות, הינו עמותה הפועלת לקידום השוויון של אנשים עם מוגבלות פיסית, שכלית, ונפשית, ולשילובם ולשיתופם בחברה בכל תחומי החיים.
העמותה הוקמה במאי 1999 ע"י מתכננים ואדריכלים אשר שמו להם למטרה לחזק את הקשר בין זכויות אדם ומערכות התכנון במדינת ישראל. נקודת המוצא לפעילות העמותה היא שתכנון מרחבי משפיע על הקהילה והחברה ועל זכויות האדם הבסיסיות.
מרכז המידע הישראלי לזכויות האדם בשטחים. מטרותיו העיקריות של בצלם הן להיאבק נגד הפרות זכויות האדם בשטחים, באמצעות תיעודן והבאתן לידיעת הציבור הרחב וקובעי המדיניות; להילחם בתופעת ההדחקה וההכחשה הקיימת בחברה הישראלית; ולתרום ליצירת תרבות של זכויות אדם בישראל.
עמותה שמטרתה להגן על זכויותיהם היסודיות של פלסטינים לחופש התנועה ועל האינטרסים החיוניים אשר תלויים במימוש חופש זה. גישה פועלת להתאים את פעולותיו של צה"ל לדרישותיו של המשפט הישראלי והבינלאומי.
האגודה הערבית לזכויות אדם הפועלת למען קידום זכויות המיעוט הפלסטיני בישראל.
האגושה לזכויות האזרח הוקמה בשנת 1972, כגוף בלתי מפלגתי ובלתי תלוי שמטרתו הגנה על זכויות האדם והאזרח בישראל ובשטחים הנתונים לשליטתה.
הוועד הישראלי נגד הריסת בתים הוא קבוצה פעילה ישירה בלתי אלימה המתנגדת להריסת בתים, להפקעת קרקעות, להרחבת התנחלויות, לעקירת עצים ולמדיניות ה"סגר" וה"הפרדה" בשטחים הכבושים - ע"י ישראל או בחסותה.
ארגון זכויות אדם המסייע לפלסטינים תושבי השטחים הכבושים שזכויותיהם הופרו על-ידי ישראל. באתר זה מידע הנוגע להפרות זכויות אדם אלה: חוקים ותקנות של מדינת ישראל והמימשל הצבאי, אמנות בינלאומיות, עתירות לבג"ץ ותביעות נזיקין, פסיקה של בתי משפט בישראל ומחוצה לה וכן מסמכים רשמיים ודוחות.
הקרן החדשה לישראל, הבית של היזמות החברתית בישראל, פועלת למען חיזוק הדמוקרטיה בישראל וקידום החופש, הצדק והשוויון לכל אזרחיה. הקרן משקיעה במאות ארגוני שטח המחוללים שינוי, מטפחת יוזמות חברתיות ומעצימה מנהיגים חברתיים. שתי"ל, מייסודה של הקרן, מרכז ייחודי מסוגו בעולם, מעניק ייעוץ מקצועי וארגוני למיזמים החברתיים ומסייע בהפיכת החזון למציאות.
הקשת הדמוקרטית המזרחית היא תנועה חברתית על-מפלגתית וחוץ פרלמנטרית, שמטרתה להשפיע על סדר היום הציבורי, מתוך כוונה להביא לשינוי כולל של החברה הישראלית ומוסדותיה השונים.
התנועה הוקמה ע"י קבוצת חיילי מילואים שביקשו לאפשר להם למלא את שירותם בתחומי מדינת ישראל ולא בתחומי הרשות הפלשתינאית.
ארגון ישראלי המורכב מנשים וגברים המקדישים מזמנם להילחם בפגיעה בזכויות האדם בשטחים הכבושים. החברים והחברות ביש דין באים מרקע אישי, פוליטי ומקצועי שונה, אך מאחדת אותם החרדה העמוקה מהנזק שמסב הכיבוש לחברות הישראלית והפלסטינית.
ארגון א-פוליטי,ללא מטרות רווח אשר פועל להגנה על זכויותיהם של מהגרי עבודה וקורבנות הסחר בנשים.
ארגון של נשים ישראליות פעילות שלום, הקיים מאז פברואר 2001. לארגון עמדה פוליטית חד משמעית נגד הכיבוש הישראלי בשטחים ונגד הדיכוי השיטתי של העם הפלסטיני.
מכון אריק לפיוס סובלנות ושלום הוקם להנצחתו של החייל אריה צבי פרנקנטל הי"ד שנחטף ונרצח ע"י החמאס ביום 7/7/94. המכון שם עצמו למטרה להראות את המציאות בשטח, לקדם דיאלוגים, הבנה וקבלת האחר, ולהביא לפיוס בין שני העמים: הישראלי והפלסטיני.
מרכז מוסאוא, לזכויות האזרחים הערבים בישראל נוסד בשנת 1997 כעמותה ללא מטרות רווח ביוזמת פעילי עמותות וארגוני זכויות. המרכז הינו ארגון זכויות עצמאי, שאינו מפלגתי, הפועל לשינוי מעמדם ומצבם של האזרחים הערבים פלסטינים בישראל.
מרכז בפקולטה למשפטים באוניברסיטה העברית. עוסק בקידום ותיאום פעילויות אקדמיות ומחקריות בתחום זכויות האדם.
